1943年，战争的天平逐渐向盟军倾斜。在非洲战场上，德军节节败退，尽管如此，德军高层仍决定继续向非洲派遣部队，其中包括最新成立的虎型战车营。这一决策在当时就引发了激烈的争议。古德里安将军曾据理力争，试图阻止这一“飞蛾扑火”般的行动，但最终毫无结果。这些虎型战车最终被派往西西里岛，古德里安力主将其撤回欧洲大陆，但遭到了戈林的反对。戈林以虎型战车无法渡过墨西拿海峡为由，坚持将其留在岛上。古德里安则反驳说，只要能赢得空中优势，虎型战车就能安全撤出。然而，这一争论最终以虎型战车留在西西里岛而告终。
1943年4月30日，古德里安前往巴黎，计划拜访西线战场总司令龙德施泰元帅，并视察西线的装甲部队，同时考察大西洋长城的防御能力。然而，希特勒的一封电报改变了他的行程，他被召唤到慕尼黑参加一场重要的军事会议。5月2日，古德里安抵达慕尼黑，会议在5月3日和4日举行，出席者包括OKW和OKH的重要人员、南方集团军总司令曼斯坦因、中央集团军总司令克卢格等。会议的核心议题是1943年夏季东线战场上是否发动攻势。
陆军参谋总长蔡兹勒提出了一个攻击计划，主张通过双重包围消灭苏军在库尔斯克以西的突出地区。他认为，凭借新型的虎、豹战车，德军足以获得决定性胜利。然而，这一计划遭到了穆德尔将军的反对。穆德尔指出，苏军已经在德军计划进攻的地区构筑了纵深且坚固的防御阵地，并且早已将机动部队撤出突出地区，对德军的钳形攻势早有准备。他建议要么采取全新的战术路线，要么放弃整个构想。希特勒对穆德尔的意见极为重视，这表明他并不完全赞同蔡兹勒的计划。
希特勒首先要求曼斯坦因元帅发表意见。曼斯坦因认为，如果在4月发动攻势，成功的机会较大，但现在已经太晚了。他还提出需要增加两个步兵师的生力军，但希特勒明确表示无法提供。克卢格元帅的态度则较为含糊，他大致上赞成蔡兹勒的计划。古德里安随后发言，坚决反对进攻计划。他认为，德军刚刚完成东线部队的再编组和再装备，此时进攻将使战车遭受严重损失，而1943年的产量无法补充。他强调，新战车应该用于建立西线的机动总预备队，因为盟军在1944年必然会尝试登陆。此外，他还指出豹型战车的技术问题尚未完全解决，进攻前难以保证其可靠性。生产部长史贝尔也支持古德里安的观点，但会场上只有他们两人公开反对蔡兹勒的计划。最终，会议没有得出结论，希特勒仍然犹豫不决。
在慕尼黑会议期间，古德里安还经历了一件私人恩怨。自1941年12月以来，他与克卢格元帅的关系一直紧张。在会议中，克卢格对古德里安态度冷淡，这进一步加剧了两人之间的矛盾。会后，克卢格古德里安到另一间房间，要求他解释为何态度冷漠。古德里安坦诚地表达了自己对1941年12月误会的不满，两人最终不欢而散。不久后，克卢格通过希孟德向古德里安传达了决斗的意图，尽管他知道希特勒早已禁止战时将军之间的决斗。希孟德代表希特勒希望双方能够大事化小，古德里安也写信给克卢格，表达了歉意，但同时也提到了克卢格之前的恶意中伤。
在战车生产方面，古德里安坚持继续生产Ⅳ型战车，直到豹型战车能够大规模生产为止。他还要求加强战车生产中心的防空准备，并在5月4日的会议上提出为战车工厂设备准备双套方案，但遭到了史贝尔助手绍尔的反对。绍尔认为盟军只会集中力量攻击德国的航空工业中心，无暇顾及战车工业。
5月10日，希特勒回到柏林，与古德里安讨论豹型战车的生产问题。工业界表示无法完成原定计划，但承诺在5月31日交付324辆（原定250辆）。在会议结束时，古德里安抓住机会，力劝希特勒放弃东线的进攻计划。他指出，进攻计划困难重重，得不偿失，还会削弱西线的防御。希特勒最终表示，他并没有决定实施该计划。
5月24日至29日，古德里安视察了多个战车营和训练班，并前往圣纳泽尔要塞，研究大西洋长城的防御能力。他发现，尽管宣传中大西洋长城坚不可摧，但实际上其防御能力远不如宣传中的那样强大。这一发现让古德里安对西线防御的可靠性产生了怀疑。
1943年7月5日，德军在东线发动了“卫城作战”，这是二战中规模最大的坦克战之一。德军在南线投入了10个装甲师、1个装甲步兵师和7个步兵师，北线则有7个装甲师、2个装甲步兵师和9个步兵师。然而，这次进攻从一开始就注定了失败的命运。德军的战术过于陈旧，苏军早已熟悉并做好了准备。尽管德军战车部队作战勇敢，但由于豹型战车的技术问题和步兵的协同不足，进攻最终停滞不前。苏军在7月15日开始反攻，德军的攻势进一步减弱，最终不得不撤退。
“卫城作战”的失败对德军来说是一次决定性的挫折。装甲师遭受了严重损失，恢复元气需要很长时间。东线的局势变得更加严峻，苏军不断发挥主动优势，德军则陷入了被动防御的困境。
7月15日，古德里安前往法国视察西线的装甲部队。7月底，他在塞纳河附近的训练地区视察虎型战车单位时，突然接到希特勒的电报，要求他前往东普鲁士开会。然而，古德里安在开会时病倒了，他患上了痢疾，不得不躺在病床上。病情稍有好转后，他立即返回柏林接受治疗，但8月初又不得不接受手术，直到8月底才康复。
在古德里安生病期间，克卢格元帅通过托瑞斯寇将军向他传达了和解的意愿，并提出合作限制希特勒的统帅权。然而，古德里安深知克卢格性格不稳定，拒绝了这一建议。
古德里安的病情逐渐好转，但柏林自1943年8月起开始遭受猛烈空袭，他不得不搬到上奥地利的一家小旅馆休养。9月3日，他得知柏林的家被炸毁，财产损失严重。幸运的是，希孟德安排了一处房地产赠予他，古德里安欣然接受了这一安排。
在古德里安请病假期间，有人试图停止Ⅳ型战车的生产，转而生产突击炮。同时，托德组织主张将战车的旋转炮塔安装在碉堡中，用作要塞炮。这些提议无疑会对德军的机动战车实力造成严重打击。古德里安销假后，立即着手研究防空战车问题。希特勒批准了建造双连装37mm高射炮的计划，但反对将已经制造好的四连装20mm高射炮安装在豹型战车上，这使得防空武器的生产一再拖延。