我们都知道火影中有一个组织那就是团藏控制的“根”，这个组织和另外一个组织非常的像，但是有很大的差别，千万不要以为这个组织就是暗部。暗部是直属火影管辖的，而根则不受火影的控制，甚至是火影的对立面。二代死后猿飞当上火影，团藏也成立了自己的组织，也是木叶村最为黑暗的部分。团藏起初的目的是为了杀掉三代，而成长自己的势力，但是结果我们都知道团藏并没有如愿，却为木叶输出了不少的人才。
卡卡西开始就是根组织的一员，也是刺杀三代火影中的十个成员之一。不过卡卡西靠着自己的智慧，在进入木叶禁地之后了解了一些不为人知的事情，后来反水成为了三代火影得力的助手，也是五代最为信任的人之一，最后成为了第六代火影，也算是团藏为木叶输出的第一个人才。
鼬曾经也是效力于根，为了木叶的安宁将宇智波一族尽数杀尽。后辗转于晓组织，但是鼬一直在暗中保护着自己的弟弟，维护着木叶的安宁。也是第四次忍界大战中的关键人物，解开了兜的秽土转生，大大促进了第四次忍界大战的终结。
大和曾效力于根组织，大蛇丸的试验品，以木遁为长，后被卡卡西引导成为了木叶的一大战力，曾一度成为鸣人的老师。但是比较悲催的是大和一生都被卡卡西捉弄，曾一人暗杀三代火影，只不过被卡卡西化解。
根组织还有一位厉害忍者油女取根，擅长毒虫，一直效力于团藏，最后被带土杀死。第四次忍界大战中被秽土转生，志乃战胜取根后被封印。
根从建立之初就被视为村子最黑暗的部分，在宇智波灭族一案发生之后被取消，但是后又因为团藏和大名们的运作而秘密的存在着，并且吸收着木叶中优秀一族的后人。三代时期被称为木叶的顶峰，我想和根组织的存在也有一定的关系，根在监视木叶一举一动的同时也为木叶输出了不少的人才。