双弹瓦斯，小次郎出场自带的宝可梦。是一次在岁暮的时候收到的宝可梦，出场用它和武藏一起来干坏事抓皮卡丘。在一次地鼠事件中和阿伯蛇一起进化为了双弹瓦斯，平时大多数时候就是用来放烟雾弹。直到超世代，为了保护同伴，在小次郎他们的掩护下带着同伴消失在了丰缘的野外，自此再也没有出场。
大食花，初登场就是小次郎说自己把口袋花放在饲育屋里，结果正式见到它的时候就已经进化成了大食花。之后到了城都地区，武藏和喵喵被鱼王大叔忽悠，被迫拿它和口袋花交换，结果这只口袋花也进化了。没错，小次郎其实有过两只大食花，并且这两只大食花一见钟情私奔了。
卡蒂狗，其实严格来说这只卡蒂狗才是小次郎的第一只宝可梦，它是小次郎童年唯一的朋友。比起其他宝可梦，这只卡蒂狗更像一个宠物，它甚至有巨大的豪宅，还有专门的人带它去其他地方玩。这只卡蒂狗虽然看似生活在溺爱中，但并非单方面享受溺爱，它对小次郎很好，需要战斗时会站出来，还会主动帮助小次郎逃脱未婚妻的纠缠。即便小次郎不在身边，它也能独自忍受寂寞，堪称 “绝世好狗”。
刺球仙人掌，起初因帮助小次郎赶走大针蜂，小次郎为表感谢将其收下，自此它对小次郎产生好感。在小次郎他们告别双弹瓦斯后，刺球仙人掌主动跟上小次郎，一同旅行至神奥地区。神奥地区的馆主菜种看中了它的实力，为了让它修炼 “吸取拳”，小次郎经过痛苦抉择，将它交给菜种培养。后续剧情提到，在菜种手下，刺球仙人掌的实力提升了很多。
风铃铃，是小次郎从小就心心念念的宝可梦。直到超世代篇，小次郎终于遇到这只风铃铃，便带着它一同旅行，直到返回关都地区。后来风铃铃因身患重病，小次郎不得不将它托付给一对老爷爷老奶奶照顾。
魔尼尼，是在风铃铃被留下后遇见小次郎的。它对小次郎一见钟情，似乎是为了安慰因风铃铃离去而失落的小次郎，主动加入了小次郎的队伍。之后小次郎一直带着它，甚至一同走完了神奥地区的旅程。
尖牙笼，是小次郎童年在神奥地区的玩伴。当小次郎回到神奥地区后，找到了尖牙笼，便带着它一起旅行，旅程结束后将它安置在了火箭队基地。
小次郎在合众地区收服的宝可梦，依旧是通过食物收服的，但由于合众篇中火箭队的戏份极少，这只宝可梦也没什么出场机会。此外，败露球菇是在《超级愿望》后期登场的宝可梦，没有展现收服过程，戏份同样很少。
好啦鱿，是小次郎在卡洛斯地区通过 “食物收服大法” 收服的宝可梦。这只好啦鱿最特别的一点是，曾被自己的进化型（乌贼王）控制，因此十分讨厌三只乌贼王，即便为了小次郎，它也决心要打倒它们，后续也确实做到了。
好坏星，是小次郎在阿罗拉地区收服的宝可梦，外形可爱。因为小次郎被毒后脸部的模样，和它的初恋很像，所以好坏星主动跟随小次郎。甚至在好坏星加入后，火箭队还首次实现了战胜小智皮卡丘的壮举。后来好坏星遇到了初恋，对方想与其复合，但此时好坏星已更喜欢小次郎，便拒绝了初恋。有趣的是，在后续剧情中，好坏星的初恋最终变成了它的情侣，情节十分搞笑。
莫鲁贝可，是小次郎在《宝可梦旅途》中收服的宝可梦。由于莫鲁贝可食量极大，让火箭队众人十分苦恼，甚至一度想办法让小智等人收服它，但最终莫鲁贝可还是选择和小次郎一起同行。这只莫鲁贝可在队伍中主要作用就是 “纯卖萌”，没有太多战斗戏份。