在《火焰纹章if》中，新增一种名为“暗器”的武器种类，在传统的火纹“剑”、“斧”、“长枪”、“魔法”、“弓”等几大武器中，暗器将会以最新的武器种类，在《火焰纹章if》中登场，暗器能够进行单格射程的临接攻击以及跨格攻击的中距离攻击，暗器具有特殊的效果，使用暗器攻击后，可以具有削弱敌方单位的特殊能力。
传统作品中魔法也具有属性相克的概念，但本作中，魔法也属于武器种类的一种，因此全新的克制关系改为“剑、魔法克制斧、弓”、“斧、弓克制长枪、暗器”、“枪、暗器克制剑、魔法”，另外传统的弓克制天马骑士也依旧有效，某些特殊武器针对特定职业而有特别效果的特攻系统也依旧存在。
这次作品根据主人公的特殊身份，新增了“女仆”、“执事”等较为新奇的全新兵种以及忍者兵种，女仆、执事在战场上能够使用暗器和回复杖，是一种兼备了攻击、debuff异常（暗器效果）、回复等三大能力强力万能职业。
游戏中，根据玩家所选阵营的不同，除了游戏的基础系统和剧情会有巨大差异以外，玩家能够使用的武器也将会有较大的变化，这是由于两个敌对国家文明阵容不同的关系所导致。即使同样是长枪武器，在暗夜王国称作长枪，但在白夜王国将会称为“薙刀”，性能方面也会有所不同，当然，装备时候的画面也会有差别。
本作的武器虽然将不会有耐久度，但这并非意味着玩家就可以尽情使用高能力的强力武器，本作战斗单位在使用武器的时候，越强力的武器会给予使用单位越厉害的能力低下debuff，另外游戏中，杖依旧有使用限制次数。
例如游戏中青铜剑和铁剑属于标准武器，而相对威力高级的钢剑除了降低回避率以外，还会附带降低二次攻击“追击”的几率，更高级的银剑则在命中敌人后，使用者的力和技减少的负面作用，勇者之剑必定产生2次攻击，但装备的时候防御力大幅降低。
新登场人物介绍：
固定我方新角色：
●菲利希亚 フェリシア(CV:ささきのぞみ) 兵种：女仆
主人公在暗夜王国生活时，负责照料主人公的强力女仆，性格开朗且认真努力，但似乎是个粗心大意的人，游戏中无视玩家所选的国家固定为我方阵容，使用武器为暗器短剑，菲利希亚的短剑暗器似乎是插在吊带袜上的哦。
●乔克 ジョーカー(CV:諏訪部順一) 兵种：执事
与菲利希亚一样，无视玩家所选的国家固定为我方阵容，且负责为主人公服务的执事，是一位能够做家务、杂务、战斗的万能执事。沉着冷静，对待主人公一般比较冷漠。
●裘达 ギュンター(CV:納谷六朗) 兵种：高级骑士
曾在过去于暗夜王国中有着丰功伟绩的伟大骑士，现在则是主人公的训练老师，严厉而又不失温柔的老爷爷角色。同样无视玩家所选的国家固定为我方阵容。
●凉风 スズカゼ(CV:小野大輔) 兵种：忍者
历来服侍于白夜王国的忍者家系出身的忍者，凉风自身没有特定的主人，与他的哥哥不同的是一名尊重礼仪的青年。
白夜王国限定的我方角色：
○彩藏 サイゾウ(CV:新垣樽助) 兵种：忍者
重要人物角色龙马（即白夜王国的王子，主人公的亲身哥哥）的直属手下，与凉风不同的是，他是一位热血汉子。
○阳炎 カゲロウ(CV:村川梨衣) 兵种：忍者
同样为侍奉于龙马的女忍者，经常会负责让没头没脑的彩藏冷静下来的重要人物。